Vi utførte to typer Computational Analysis

Inkludering av disse produksjons proteiner i det bygges vei veien bidrar til å vite veien Hedgehog signalveien håndterer de viktigste utviklingsprosedyrer OFA celle, inkludert celledeling, celle ekspansjon og også kombinasjonen talkswith andre gangveier . Videre er det svært viktig å huske på at de fleste av theoutput kjøtt vist mens i veien var også teinene og dermed relatert denne veien ved hjelp av flere typer malignancies.Imatinib

Videre har vi samlet ERK12, RAS, Vinkel, FAS, NOTCH1, som ikke er kjerne pinnsvinet sti proteins.The inkludering av disse proteinene i vår rekonstruert kartet var toshow lovgivningen eller kryss snakker om pinnsvin pathway bruker othermolecules fra forskjellige signalveier som WNT, LEVEL, MAPK etc. Inkludert disse ikke-kjerne proteiner, så langt som litteratur og depotet er involvert, denne rekonstruerte kartet Hedgehog signalveien viser de aller beste mengde ofmolecules og interaksjoner, og er anerkjent som for ytterligere computationalanalysis.In denne funksjonen, utførte vi to typer matematisk analyse, Graph teoretisk og boolsk eller Rational analyse.

så som toidentify de viktige kjøtt fra nettverket, ble parameterne som brukes i data teoretiske analysis.We sees at GLI1 var en av de viktigste protein i theentire nettverk og etablert en &lsquo ; " hub ’ &rsquo ;, som det ble vist stor valuesin alle slags nettverksparametre vurderes i denne analysis.Therefore fra vår forskning kan det være lett mistenkt thatperturbation av dette proteinet eller node i Hedgehog signalnettet vil påvirke den konvensjonelle nettverk operere og kan føre til mange typer ofcancers, som vil bli også funnet i fersk uttalelse, som inGlioma, tarmer og bukspyttkjertelkreft cellelinjer GLI1 demonstrerer overuttrykk.

i vår studie, jo større antall degreeor tilkoblinger bekreftet av PTCH1 også ment at det var en ofthe mest kritiske proteiner inne i Hedgehog vei, og dette støtter en rekke eksperimentelle studier hvor mutasjonen ofPTCH1 protein ble vist seg å påvirke bevegelsen av vanlige Hedgehogsignal og forårsake bukspyttkjertelen og kreft i tykktarmen. Høy konsentrasjon av PTCH1 protein i membranen var verdifull toregulate den utløste SMO protein i membranen, for å sikre at itcannot ytterligere aktivere GLI i cytoplasma. Den fulle AV-DEGREEshowed av SHH anbefales også at dette ligand var generelt regulatedby annen ekstracellulært protein på tidspunktet for å presentere withPTCH1per2. Det har vært eksperimentelt demonstrert at BOCboth og CDO hjelp aktivere SHH ligand, mens GAS1 sjekker den tobind med oppdatert protein i membrane.Therefore, over-uttrykk for CDO og BOC i extracellularregion forbedre bindingen handling av SHH å slutte med PTCH1 /to. UT LEVEL fordel for nuclearproteins betydde plasseringen av disse protein til prosedyre signalet til produksjons elementer på den andre hånden greater.ALK hemmer

Derfor kan mutasjon ormalfunction av proteinet i kjernen forårsaker overproduksjon av mange målrettet teinene av Hedgehogpathway. I vår forskning GLI1 opplevde funnet maksimal IN-BELØP, OUT- SAMLET STAGE og STAGE blant annet proteinsand dermed utvikle den største senter inne i full sirkel. Dette resultatet tillegg anbefales at hemming av protein wouldcompletely forstyrre standard flyt av Hedgehog signere andthereby andre cellulære funksjoner kommer til å bli disturbed.In forholdet av egenvektor sentralitet score, GLI1, SMO, PTCH1 hadde GLI3_A vist store poengsummer. Det er ment thatthese protein inkluderte ikke bare stort antall forbindelser, men også forbundet med ekstra ekstremt kjent node som kjøpte highernumber av forbindelser i nettverket.

Det absolutt var også fascinerende toobserve at selv GLI1 og GLI2 fått større antall ofconnections innenfor nettverket, waslow egenvektoren sentralitet GLI2 sammenligne GLI1. Den virkelige grunnen for denne typen behaviorwas tilkobling av GLI1 å bruke en annen større sentral nodeNUC_GLI1 i nettverket.