Syk-mediert Tilbakemelding delvis restaurert ITAM aktivering i SFK-Mangel System

Derfor er bidraget fra SFKs til fosforylering ofneighboring ITAMs liten, og våre beregninger viser at blant annet denne reaksjonen gjorde ikke endre resultatene kvalitativt .Vi neste undersøkt hvordan Syk-mediert positive tilbakemeldinger var påvirket av differentconcentrations av antigener. I nærvær av microclusters, Syk-mediert feedbackcompensated for fraværet av SFKs i aktivering ITAMs for et bredt spekter av antigenconcentrations .Bosutinib 380843-75-4

I motsetning til dette, i fravær av en hvilken som helst reseptor-gruppering, Syk -mediatedfeedback var ikke i stand til å gjenopprette ITAM aktivering i fravær av en hvilken som helst SFK aktivitet over alarge spekter av antigenkonsentrasjoner. Men på økt antigen konsentrasjoner, theSyk-mediert tilbakemeldinger delvis restaurert ITAM aktivering i SFK-mangelfullt system. Dette skjedde fordi ved høyere antigen-konsentrasjoner, selv i fravær av anyreceptor clustering, ITAM-bundet Syk-molekyler er sannsynlig å engasjere med andphosphorylate ITAMs forbundet med nærliggende BCR-antigen-komplekser. Vi fant også at terskelen for ITAM aktivering i SFK-mangelfullt system occurredat en noe økt antigen konsentrasjon i forhold til at i vill-type system. Denne endringen i terskelen for aktivering i SFK-manglende system wasmore vesentlig i fravær av en hvilken som helst romlig clustering.

Dette kan forstås inthe følgende måte. I fravær av en hvilken som helst SFK aktivitet, er de første ITAMs som bidrar toinitiate Syk-induserte positive feedback aktiveres av basalt aktiverte Syk-molekyler, som er mindre effektiv i å fosforylere ITAMs sammenlignet med SFKs; Derfor, theamount av antigen som er påkrevet for å indusere den positive tilbakekoblingssløyfe i vill-type system issmaller enn den i SFK-manglende systemer. Fordi i fravær av reseptoren clustering thepositive tilbakemeldinger kan være effektivt bare ansatt ved økt antigen konsentrasjoner, thethreshold for ITAM aktivering skjer på et mye høyere antigen konsentrasjon i absenceof noen SFK aktivitet i dette tilfellet.

Syk-mediert positive tilbakemeldinger kan også gi opphav tobistability i ITAM fosforylering for en rekke antigen konsentrasjoner og reaksjon rates.The bistabilitet oppstår på grunn av ulinearitet i feedback-indusert ITAM phosphorylationand enzymatisk defosforylering av ITAMs. Vi undersøkte også hvilken rolle BCR romlige clustering forweaker affinitet antigener. For moderat affinitet antigener, ble ITAM-aktivering i fravær av SFKs delvis gjenopprettet av Syk-mediatedfeedback i nærvær av BCR gruppering. Imidlertid, for lavere affinityligands, i fravær av SFKs, Syk var ikke i stand til å gjenopprette ITAM aktivering, fordi levetiden til BCR-antigen-komplekset blir for kort til å generere ITAMactivation gjennom Syk.

Vi testet direkte rolle positive tilbakemeldinger i ITAM aktivering mediert av Sykthrough sin evne til å fosforylere nabo ITAMs. Vi modifisert vårt computationalmodel slik at Syk-molekyler ikke fikk lov til å fosforylere en hvilken som helst nabo ITAMs.We deretter studerte kinetikken av ITAM fosforylering når enten SFK eller Syk-moleculesare fjernes fra systemet. I fravær av SFKs, konsentrasjonene av pITAMsdecreased vesentlige både i nærvær og fravær av reseptor microcluster .FG-4592 808118-40-3

Konsentrasjonen av pITAMs, selv i vill-type system, var substantiallyreduced i denne modifiserte modell i forhold til den i den opprinnelige modell hvor Syk-inducedpositive tilbakemelding var funksjonell. I den modifiserte modell, da Syk ikke var til stede, ble ITAMphosphorylation redusert med en liten mengde uten hensyn til graden av spatialclustering av BCRs. Dette skjedde fordi ITAM fosforylering av SFKs ikke ble påvirket av romlige clustering.