Feiing View of Prostate Cancer Genome Rentene Deep Insights

For første gang har forskere blottet hele genetiske blåkopi av flere prostatakreft, avdekke endringer som aldri før har blitt oppdaget og tilbyr en dyp visning av genetiske feiltrinn som ligger til grunn sykdommen. Studien, gjort mulig av viktige fremskritt i hele genomsekvense og analyse, peker på flere nye prostata kreft gener og en kritisk kategori av genomisk endringer som viktige drivere av prostatakreft vekst. Arbeidet ble ledet av forskere fra Weill Cornell Medical College, Broad Institute, og Dana-Farber Cancer Institute og vises i 10 februar utgaven av tidsskriftet Nature.Unlike andre sekvenseringsmetoder som er rettet mot bestemte deler av genomet, hele genomet sekvensering gjør det mulig for forskere å se på tvers av hele DNA landskapet i en tumor, som gjør det mulig å skjelne globale endringer og mønstre. Senior forfattere legene. Levi Garraway og Mark Rubin og deres kolleger brukte denne strategien for å se hele genomet til sju prostatakreft og sammenligne dem til normale vevsprøver for å finne områder av unormalt. "Hele genomsekvensering gir oss fascinerende ny innsikt i en kategori av endringer som kan være spesielt viktig i prostata kreft, "sier Dr. Garraway, senior assosiert medlem av Broad Institute og en medisinsk onkolog og assisterende professor ved Dana-Farber og Harvard Medical School.Prostate kreft er den nest mest dødelige kreft i amerikanske menn, ansvarlig for mer enn 30.000 dødsfall, og mer enn 200.000 nye tilfeller hvert år. Et hovedmål for prostatakreft forskningen er å identifisere potensielle narkotika mål samt genetiske egenskaper innen svulster som kan skille lat og aggressive former av sykdommen, og til slutt forbedre diagnostikk og treatment.Dr. Rubin, Homer T. Hirst professor i onkologi i patologi og nestleder for eksperimentell patologi ved Weill Cornell Medical College, sammen Nature studien til å se ikke bare for stavefeil i genomet, men også for hele avsnitt eller deler av genomisk tekst som har blitt omorganisert. "En av de store overraskelsene er at prostata kreft ikke trenger et stort antall skrivefeil, men i stedet har en stor, betydelig antall rearrangements," sier Dr. Rubin, som også er en patolog ved NewYork-Presbyterian Hospital /Weill Cornell Medical Center. "Vi ville aldri ha gjettet at det var så mange genomisk endringer av denne typen før nå fordi vi ikke har de riktige verktøyene for å se etter dem." Disse endringene er kjent som genomisk rearrangements â € "en slags shuffling som oppstår når en del av DNA fra en del av genomet bryter av og reattaches seg på et annet sted. Disse rearrangements kan opprette nye gener (kalt "fusion gener"), at et gen for å drive ukontrollert, eller hindre et gen fra selv å jobbe i det hele tatt. Slike endringer kan sette en celle på en sti mot kreft. Ved å se etter gener som er berørt av disse rearrangements i flere prostatakreftprøver, forskerne avdekket nye gener knyttet til sykdom og funnet nye mekanismer som kan kjøre kreft som en helhet. Prostatakreft prøvene ble gitt av Dr. Ashutosh Tewari, Ronald P. Lynch professor i Urologiske Oncology og professor i urologi og folkehelse ved Weill Cornell Medical College og en robot urologisk kirurg og leder for LeFrak Senter for Robotic kirurgi ved NewYork- Presbyterian /Weill Cornell. "Dette første hele genomet visningen viser oss fristende bevis for flere nye prostata kreft gener som trolig ville ha forblitt uoppdaget hadde vi ikke tatt et genom-wide tilnærming," sier Dr. Garraway.Several svulster inneholdt rearrangements forstyrre genet som koder for proteinet CADM2, en del av en familie av proteiner som hindrer tumorer dannes (kjent som "tumor-suppressorer"). Tre prøver inneholdt også mutasjoner som involverer medlemmer av heat shock protein familie, molekyler som spiller en viktig beskyttende rolle og holder proteiner fra å miste sin rette form. Anti-kreft legemidler som hemmer disse proteinene er for tiden i kliniske studier, men det er ennå ikke klart om prostatakreft vil være sårbare for slike drugs.Other gjentakende genomiske rearrangements involvere genene PTEN og MAGI2. PTEN er en velkjent tumorsuppressorgenet og MAGI2 synes å være sin fadder; mutasjoner i ett eller begge gener kan sette cellene på veien mot å bli kreft. Legemidler som hemmer veien disse genene påvirker er også under utvikling, øke muligheten for at medisinene kan brukes til prostata cancer.In tillegg til å avdekke nye og mistenkt gener, har hele genomsekvense også gitt legene. Garraway, Rubin og deres kolleger innsikt i hvordan genomisk rearrangements oppstår i første omgang. Med en katalog over rearrangements i hånden, så forskerne for hvor pauser og reattachments tendens til å skje, og fant at disse hendelsene ikke er fordelt tilfeldig over genomet. Heller, i noen tumorer disse hendelsene har en tendens til å finne sted i områder av genomet som er inaktive eller stille, mens man i andre tumorer de forekommer i områder som er meget aktive. Dette mønsteret tyder på at feil gjort av celler mens du slår gener av og på kan gi opphav til DNA rearrangements og derfor spille en formativ rolle i kreft er development.The forskernes funn kan også gi et viktig utgangspunkt for utvikling av nye diagnostiske verktøy for prostata kreft. Foreløpig når pasienter diagnostisert med prostatakreft, er det nesten umulig for legene å finne ut om sykdommen vil avansere raskt og derfor krever aggressiv behandling, eller om svulstene vil forbli saktevoksende, nødvendiggjør en vente-og-se-tilnærming. "Denne studien kan forbedre vår evne til å utvikle nye, diagnostiske markører for prostatakreft," sier Dr. Rubin. "Vi kan også tenke seg etterhvert utvikle mer personlige diagnoseverktøy for pasienter med tilbakevendende svulster, til hovedsak følge svulstene 'progresjon ved å teste for nye genomiske forandringer.» Selv om forskernes funn må undersøkes videre og utvidet til et større antall kreftprøver dette innledende analyse har åpnet opp mange nye muligheter for etterforskning, understreker kraften til å bruke hele genomsekvense til kreft. "mange av disse funksjonene var usynlig før," sier Dr. Garraway. "Nå er vi klar over at ved å sekvensere hele genomet i prostata kreft, det er mye mer å se. Disse oppdagelsene lærer oss mye om sykdomsutviklingen at vi rett og slett ikke hadde verdsatt tidligere." Medforfattere av studien omfatter Dr. Francesca Demichelis (hovedforfatter), Raquel Esgueva, Kyung Park, Dorothee Pflueger, Naoki Kitabayashi, og Theresa Y. MacDonald fra Weill Cornell; Michael F. Berger (hovedforfatter), Michael S. Lawrence (hovedforfatter), Kristian Cibulskis, Andrey Y. Sivachenko, Carrie Sougnez, Robert Onofrio, Scott L. Carter, Lukas Habegger, Lauren Ambrogio, Timothy Fennell, Melissa Parkin, Gordon Saksena, Douglas Voet, Alex H. Ramos, Trevor J. Pugh, Jane Wilkinson, Sheila Fisher, Wendy Winckler, Scott Mahan, Kristin Ardlie, Jennifer Baldwin, Stacey B. Gabriel, Todd R. Golub, Matthew Meyerson, Eric S. Lander og Gad Getz fra The Broad Institute of Harvard og MIT; Yotam Tørrere (hovedforfatter) fra Weizmann Institute of Science, Israel; Andrea Sboner og Mark B. Gerstein fra Yale University, Jonathan W. Simons fra Prostate Cancer Foundation, Santa Monica, California .; og Philip W. Kantoff og Lynda Chin fra Dana-Farber Cancer Institute.Funding for prosjektet ble gitt av Prostate Cancer Foundation, Howard Hughes Medical Institute, National Human Genome Research Institute, Kohlberg Foundation, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Department of Defense, Dana-Farber /Harvard Cancer Center prostatakreft SPORE stipend, og Starr Cancer Consortium.Dr. Mark Rubin er co-oppfinner av oppdagelsen av å se på prostatakreft i sammenheng med TMPRSS2-ETS omorganisering. Dr. Rubin oppdagelse har blitt brukt i denne studien, og Dr. Rubin mottar royalties fra Brigham and Women Hospital, som har lisensiert sin oppdagelse til Gen-Probe Incorporated og Ventana Medical Systems, Inc. I tillegg serverer Dr. Mark Rubin som en konsulent for Gen-Probe Incorporated og Ventana Medical Systems, Inc.WEILL Cornell Medical COLLEGEWeill Cornell Medical College, Cornell University Medical school som ligger i New York City, er forpliktet til kvalitet i forskning, undervisning, pasientbehandling og fremme av kunst og vitenskap medisin, lokalt, nasjonalt og globalt. Leger og forskere av Weill Cornell Medical College er engasjert i cutting-edge forskning fra benk til sengen, med sikte på å låse opp mysterier menneskekroppen i helse og sykdom, og mot å utvikle nye behandlinger og forebyggende strategier. I sitt engasjement for global helse og utdanning, har Weill Cornell en sterk tilstedeværelse på steder som Qatar, Tanzania, Haiti, Brasil, Østerrike og Tyrkia. Gjennom historiske Weill Cornell Medical College i Qatar, er Medical College den første i USA for å tilby sin M.D. grad utenlands. Weill Cornell er fødestedet til mange medisinske fremskritt â € "inkludert utvikling av Pap test for livmorhalskreft, syntesen av penicillin, den første vellykkede embryo-biopsi graviditet og fødsel i USA, den første kliniske utprøving av genterapi for Parkinsons sykdom, og sist, til verdens første vellykkede bruk av dyp hjernestimulering behandle et minimalt bevisst hjerneskadet pasient. Weill Cornell Medical College er tilknyttet New York-Presbyterian Hospital, hvor fakultetet gir omfattende pasientbehandling ved New York-Presbyterian Hospital /Weill Cornell Medical Center. The Medical College er også tilknyttet Methodist Hospital i Houston. For mer informasjon, besøk weill.cornell.edu.BROAD INSTITUTE OF Harvard og MITThe Eli og Edythe L. Broad Institute of Harvard og MIT ble lansert i 2004 for å styrke denne generasjonen av kreative forskere til å transformere medisin. The Broad Institute søker å beskrive alle de molekylære komponentene i livet og deres forbindelser; oppdage det molekylære grunnlaget for viktige menneskelige sykdommer; utvikle effektive nye tilnærminger til diagnostikk og terapi; og formidle funn, verktøy, metoder og data åpenlyst til hele vitenskapelig community.Founded ved MIT, Harvard og dets tilknyttede sykehus, og de visjonære Los Angeles filantroper Eli og Edythe L. Brede omfatter Broad Institute fakultetet, faglig ansatte og studenter fra gjennom MIT og Harvard biomedisinsk forskningsmiljøer og utover, med samarbeid som strekker seg over hundre private og offentlige institusjoner i mer enn 40 land over hele verden. For ytterligere informasjon om Broad Institute, gå til www.broadinstitute.org.DANA-Farber kreft INSTITUTEDana-Farber Cancer Institute (www.dana-farber.org) er en rektor lære affiliate ved Harvard Medical School og er blant de ledende kreft forskning og barnehager i USA. Det er en av grunnleggerne av Dana-Farber /Harvard Cancer Center (DF /HCC), utpekt en omfattende kreftsenter ved National Cancer Institute. Det gir voksen kreftomsorg med Brigham and Women Hospital som Dana-Farber /Brigham og kvinner Cancer Center og det gir pediatrisk forsiktighet ved Children Hospital Boston som Dana-Farber /Barnas Hospital Cancer Center. Dana-Farber er de beste rangerte kreftsenter i New England, ifølge USNews & World Report, og en av de største mottakerne blant uavhengige sykehus av National Cancer Institute og National Institutes of Health gi finansiering.